חידושים בגילוי מוקדם של סיכון לסרטן באמצעות ריצוף גנומי

קפיצה לפרק

• ריצוף גנומי להערכת סיכון לסרטן
• רפואה מותאמת אישית באמצעות נתונים גנומיים
• פרמקוגנומיקה ותגובה לתרופות
• גילוי מוקדם של סרטן באמצעות תובנות גנומיות
• עתיד הריצוף הגנומי בשירותי הבריאות
• תמליל מלא

ריצוף גנומי להערכת סיכון לסרטן

ד"ר נדיר ארבר, MD, מסביר כיצד ריצוף דור חדש (Next-Generation Sequencing, NGS) וריצוף אקסום מלא (Whole Exome Sequencing, WES) מספקים תובנות מפורטות על סיכונים אישיים לסרטן. טכנולוגיות אלה מאפשרות זיהוי מוטציות DNA שיכולות להשפיע משמעותית על החלטות אבחון וטיפול. באמצעות ניתוח הגנום של האדם, נותני שירותי בריאות יכולים לחזות טוב יותר סיכונים לסרטן ולהתאים אסטרטגיות מניעה בהתאם.

רפואה מותאמת אישית באמצעות נתונים גנומיים

ד"ר נדיר ארבר, MD, מדגיש את תפקיד הנתונים הגנומיים בהתאמה אישית של הטיפול הרפואי. ככל שהריצוף הגנומי הופך נגיש יותר, אנשים יקבלו מידע בריאותי מותאם אישית שיכול להנחות את החלטותיהם הרפואיות. גישה זו מאפשרת אסטרטגיית מניעה ממוקדת יותר, המתמקדת בנטיות גנטיות ספציפיות למחלות שונות, כולל סרטן.

פרמקוגנומיקה ותגובה לתרופות

ד"ר נדיר ארבר, MD, דן בחשיבות הפרמקוגנומיקה בהבנת כיצד שונות גנטית משפיעה על תגובות לתרופות. נתונים גנומיים יכולים לחשוף כיצד אנשים מפרקים תרופות באופן שונה, מה שחיוני לאופטימיזציה של מינוני תרופות והקטנת תופעות לוואי. גישה מותאמת אישית זו מבטיחה טיפולים בטוחים ויעילים יותר למטופלים.

גילוי מוקדם של סרטן באמצעות תובנות גנומיות

ד"ר נדיר ארבר, MD, מדגיש את הפוטנציאל של ריצוף גנומי בגילוי מוקדם של סרטן. באמצעות זיהוי מוטציות גנטיות הקשורות לסיכון מוגבר לסרטן, נותני שירותי בריאות יכולים ליישם אסטרטגיות התערבות מוקדמות. גישה פרואקטיבית זו יכולה לשפר משמעותית את התוצאות על ידי תפיסת הסרטן בשלב מוקדם וניתן יותר לטיפול.

עתיד הריצוף הגנומי בשירותי הבריאות

ד"ר נדיר ארבר, MD, צופה עתיד שבו ריצוף גנומי הוא חלק אינטגרלי משירותי הבריאות. ככל שעלות הריצוף ממשיכה לרדת, יותר אנשים יקבלו גישה למידע יקר ערך זה. ד"ר ארבר חוזה כי בתוך העשור הבא, נתונים גנומיים אישיים ישמשו באופן נרחב להנחיית החלטות בריאות, מה שיוביל למניעה וטיפול טובים יותר במחלות.

תמליל מלא

ד"ר אנטון טיטוב, MD: ריצוף דור חדש, NGS, וריצוף אקסום מלא, WES, מאפשרים הערכה מפורטת יותר של סיכונים אישיים לסרטן וחיזוי תגובות לתרופות רבות. כאשר ילד נולד, בקרוב רופאים ימסרו דיסק און קי עם הגנום של הילד, שיעזור להעריך סיכונים בריאותיים לכל החיים. אחד מכל ארבעה אנשים מתגלה עם מוטציות DNA שמשפיעות על שיקולי אבחון וטיפול.

ד"ר אנטון טיטוב, MD: הערכת סיכון לסרטן באמצעות ריצוף דור חדש, NGS, וגילוי מוקדם של סיכון לסרטן באמצעות ריצוף אקסום מלא, WES, הופכים פופולריים וזמינים יותר. ריצוף דור חדש בהחלט זול יותר. מהן ההזדמנויות לבדוק סיכונים מוגברים לסרטן באמצעות ריצוף גנום מלא?

ד"ר נדיר ארבר, MD: אני חושב שזה הכיוון. זו אסטרטגיה לאבחון מוקדם של סרטן בעתיד הקרוב. יש פרויקט של האיחוד האירופי 2020 או Horizon 2020. כך אני מדמיין ריצוף גנים לגילוי סיכון לסרטן. ילד יוצא מחדר הלידה, ורופאים ייתנו להורים דיסק קטן או דיסק און קי עם המילים, "זה הגנום של הילד שלכם". בכל פעם שאתם פונים לרופאים, היו זהירים—הם מסוכנים! התייעצו עם נתוני ה-DNA האלה כי הוכח שגנים משפיעים על האופן שבו אתם מגיבים לתרופות.

ד"ר נדיר ארבר, MD: כאשר אני נותן למישהו עם חום פאראצטמול, אני נותן 500 עד 1000 מיליגרם לכולם. אבל ברור שלכולם יש קצב מטבוליזם שונה ויגיבו אחרת. עם פאראצטמול, הפער בין יעילות לרעילות הוא גדול. אתה לא מודאג משום דבר. אבל עבור תרופות אחרות, חלון הטיפולי צר בהרבה. גילוי סיכון לסרטן בהחלט שווה גישה אישית. זה נקרא פרמקוקינטיקה.

ד"ר נדיר ארבר, MD: נתונים גנומיים יכולים גם לספר לנו הרבה על הסיכון לפתח סרטן מסוגים שונים, המחלות שאתה prone להן, והיכן אתה צריך למקד את מאמצי המניעה שלך. לפעמים למישהו יש הרבה גנים predisposing להשמנה. אז נוכל לעקוב אחר המשקל בקפידה רבה יותר, או vice versa. אני חושב שריצוף גנום מלא יגיד לנו הרבה על סיכונים בריאותיים אישיים. ברור שזה לא יחליף את הרפואה הקלינית, אבל זה יעזור לנו מאוד בחינוך מטופלים.

ד"ר נדיר ארבר, MD: ריצוף גנום אישי יעזור למנוע מחלות ולהתגבר עליהן. ריצוף אקסום מלא יגיד לנו כיצד לחנך מטופלים. נתונים גנומיים אישיים בהחלט ישמשו much sooner than many think. בעשור הבא, זה יקרה. רוב האנשים הבריאים בהמיספירה המערבית ישתמשו בנתונים גנומיים אישיים. מחירי ריצוף גנים יירדו לכמה מאות דולרים, מה שיהפוך אותם לנגישים לכולם.

ד"ר אנטון טיטוב, MD: פרסמתם מאמר מאוד מעניין שבחן 25 אנשים בריאים. מתברר ש-24% מהם—כמעט 1 מכל 4—יש מוטציות DNA "management changing". מוטציות אלה יכולות predispose אותם לסיכון מוגבר לסרטן ולמחלות לב. 80% מהאנשים שנבדקו harbored 1 עד 3 מוטציות שונות. מוטציות אלה required alterations במינוני תרופות שאושרו על ידי ה-US FDA. האם תוכל לספר לנו על ריצוף גנים למציאת מוטציות סרטן באנשים בריאים?

ד"ר נדיר ארבר, MD: הופתעתי. לא ציפיתי ל so much knowledge מריצוף DNA genome זה. זה going to change my clinical judgment. שיטות הגילוי המוקדם שלנו לסרטן ישתנו not only for me but for my entire team. ואכן, עשינו. מצאנו מישהי prone to develop סרטן שד because she had a BRCA mutation, but clinical history did not tell us about breast cancer risk.

ד"ר נדיר ארבר, MD: הייתה לנו בת ואמה. לאמא יש tendency to develop פוליפים במעי הגס. Whenever I did a colonoscopy, I found polyps. Then we found a gene that predisposed her to colon polyps and colon cancer. It showed us matching between the genotype and the phenotype. הבת לא had this gene. We told the daughter this, so we don't have to do a new colonoscopy every 1-2 years because she does not carry the gene that her mother carries.

ד"ר אנטון טיטוב, MD: You can have it both ways. All this information was just from whole exome sequencing. I think the fidelity of sequencing was not that great. In the future, we will improve whole genome sequencing quality. I'm sure we can gain much more information about early cancer detection. But there are a lot of cancer-causing genes that we still do not know about.

ד"ר נדיר ארבר, MD: We don’t know their functions. We still do not exactly know what is meaningful among all these genes. It is much more complicated. We do the whole exome sequencing, which is only about 1% of all the DNA bases. There is a lot of DNA between the exons. I don't believe in the term "garbage DNA." Everything has a meaning. But at the same time, it's very interesting that interpretation of the genome is also very important.

ד"ר נדיר ארבר, MD: Of course, there are a lot of gray areas in whole genome sequencing to find cancer risks. But some of the genes have well-known mutations that can predispose people to cancer. Therefore, we shouldn't pursue an "ostrich strategy" for cancer risk detection. We should really know what's in the genes. A mutation that is found is a clear-cut answer for cancer risk. Then it requires manual curation of the genome as was done in your paper. It requires some altered behavior with cancer risk mitigation. I absolutely agree!